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牙列不齊的病因主要可歸結為進化因素及環境因素
1.進化因素：人類漫長的進化過程，使人體許多器官發生退化。在顏面口颌系統，這種退化性縮小現象也十分明顯。研究證明，口颌器官各種成份的退化縮小存在著不平衡現象，即咀嚼肌退化最為明顯，颌骨次之，而牙齒的退化最不明顯。這樣相對較小的牙槽骨就無法容納相對較大的牙齒，導致牙齒擁擠不齊。
2.環境因素：環境因素繁多復雜，是引起牙列不齊的主要原因。重要的主要有
①食物過細 由於生活質量的提高，人們的食物越來越精細，對於發育中的青少年和兒童，過分柔軟精細的食物使咀嚼功能得不到充分的發揮，牙槽骨得不到足夠的刺激，從而颌骨生長受到限制，引起牙齒擁擠;
②不良習慣 在幼時養成的吮指、舔舌、伸舌、咬下唇及口呼吸習慣如得不到及時的糾正，那麼就會對牙齒的正常萌出及其位置排列產生不良影響，引起牙列不齊;
③替換障礙 乳牙的過早失去或逾期不落等乳恆牙替換障礙都會引起繼承恆牙萌出錯位，導致牙列不齊。
以上分析不難看出，牙列不齊的致病因素在兒童及青少年中帶有很大的普遍性，如吮指、舔舌習慣等，在幼兒中占有相當高的比例，這就導致了牙列不齊的高發病率。牙列不齊在某種程度上是可以預防的。從病因分析中，讀者不難發現，後天因素， 比如口腔不良習慣等，對產生牙列不齊起了很大的作用。所以，在孩子成長過程中，家長應該留心注意這幾方面：
①孩子是否有不良的吮指、舔舌、咬唇習慣。對於這些習慣家長應耐心指導他們加以糾正;
②孩子在替牙過程中，是否有恆牙錯位萌出的跡象，或是否有恆牙遲萌等現象。比較保險的做法是在替牙過程中帶孩子去口腔科做常規檢查，醫生會根據情況提出建議的;
③注意孩子的食物構成，應盡量多地給孩子吃些富有纖維素的食品，使咀嚼功能充分發揮並刺激颌骨發育。家長如果注意上述幾點並積極輔助孩子進行預防，那麼牙列不齊的發展趨勢可能被遏止，或在發展程度上有所減輕。但在很多情況下，特別是有先天或遺傳因素存在的情況下，牙列不齊的產生和發展很難單 純用預防的方法就能控制，所以說，絕大多數的牙列不齊需要經過矯正後才能得到糾正。